U dzieci zakażenie SARS-CoV-2 najczęściej przebiega łagodnie lub bezobjawowo, jednak w części przypadków może prowadzić do poważnych powikłań. Szczególne znaczenie kliniczne ma wieloukładowy zespół zapalny, który może rozwijać się po przebytej infekcji i wymaga intensywnego leczenia szpitalnego, ze względu na możliwe ryzyko wystąpienia niewydolności narządowej. Coraz częściej opisywanym problemem jest również Long COVID, manifestujący się przewlekłym zmęczeniem, zaburzeniami koncentracji oraz obniżeniem jakości funkcjonowania dziecka w codziennym życiu.