Duża ilość rodziców zastanawia się i poszukuje informacji czy szczepienie dzieci jest bezpieczne i konieczne. W chwili obecnej stworzyły się dwa obozy - przeciwnicy oraz zwolennicy szczepień dzieci. Według przeciwników szczepionki są szkodliwe i niedostosowane do układu immunologicznego noworodka. Wykazują oni, że prowadzą do zatrucia rtęcią (obecną w szczepionkach), co może prowadzić do poważnych i nieuleczalnych chorób jak np. autyzm, padaczka, upośledzenie umysłowe i inne. Rtęć prowadzi także do uszkodzenia komórek nerwowych (neuronów), uszkadza działanie wielu enzymów i jest przyczyną rozwoju alergii u dzieci.
Zdaniem przeciwników szczepień, do organizmu dziecka nie jest wprowadzany „czysty” wirus czy bakteria, ale także szereg innych substancji, toksycznych dla bardzo młodego organizmu.