Zdarza się jednak tak, że po szczepieniu u dziecka mogą wystąpić objawy niepożądane. Wśród najczęściej wymienianych są: zmiany skórne, ból w okolicy podania, zapalenie węzłów chłonnych, gorączka, nudności, wymioty, ból głowy, rozdrażnienie, nadmierna senność, utrata apetytu czy zaburzenia neurologiczne.

Do poważnych skutków szczepień zalicza się cukrzycę, reumatoidalne zapalenie stawów, choroby nowotworowe czy szok anafilaktyczny. Jeśli zauważymy u dziecka jakiekolwiek niepojące objawy, które nie ustępują należy jak najszybciej skontaktować się z pediatrą. Nie wolno czekać aż ustąpią one same.